后期阶段，体力分配成为核心策略之一。每日体力应优先用于主线任务，确保故事进度和基础资源获取，随后投入精英任务和角色突破任务。精英任务提供稀有碎片，而突破任务能显著提升角色战力。限时活动需额外关注，这类活动奖励稀有角色碎片或高级装备，但需提前规划体力消耗。自然恢复与道具补充需平衡，避免溢出浪费。
角色培养是基础，包括等级、技能和星级强化，优先选择攻击型或团队核心角色。忍具和饰品属性以暴击和攻击为主，暴击达标后转向攻击力堆叠。阵容搭配需考虑属性克制与技能互补，例如控制型忍者配合爆发输出。通灵兽和勾玉系统不可忽视，前者提供战场辅助，后者需均衡升级，武器勾玉等级通常比通灵兽高一级。
小队突袭开启三倍收益能加速密卷和铜币积累，但后期密卷接近满级时收益降低，需酌情减少金币投入。生存挑战和组织活动提供稳定资源，如凯碎片和轮回石。铜币短缺时可适度招财，但需控制每日次数。忍具副本建议组队完成，利用队伍加成提高效率，同时优先挑战奖励丰厚的副本。
后期对决中，替身术使用时机和技能预判直接影响胜负。需熟悉主流忍者的技能范围与冷却时间，例如抓取类技能可破解霸体状态。忍术组合需根据对手阵容调整，避免固定套路。无差别格斗模式是检验技术的场合，通过实战积累应对不同流派的经验。
零氪玩家建议专注单一方向，避免资源分散。高招忍者首付机制需提前储备金币，按S忍100抽、A忍50抽的标准准备。战力玩家需持续投入小队突袭和秘境，而收集型玩家应优先参与碎片活动。饰品和忍具强化适可而止，预留资源应对新内容。
