口袋妖怪火红遗迹山谷的探索流程需要结合特定剧情推进和技能使用。首先需要完成三周目剧情，将图鉴升级至386版后前往火焰山右侧山洞获取红宝石，随后返回博士处换取船票解锁七岛航线。遗迹山谷位于第六岛屿，需从第五岛屿的回忆之塔出发，乘船抵达第六岛屿后使用冲浪技能向右行进，穿过绿色小径和记号森林即可到达入口区域。此阶段需确保队伍中携带掌握冲浪和一字斩技能的宝可梦。
进入遗迹山谷后需注意洞穴内部结构。在绿色小径尽头的洞穴处使用一字斩开启石门，内部为多层迷宫设计，需按特定路线行进：先向上，再向左，随后向右，最后向下移动可抵达蓝宝石所在区域。获取蓝宝石后触发剧情被火箭队抢夺，会获得仓库密码片段。该区域存在多个训练家对战点，建议提前准备恢复道具以应对连续战斗。
返回第五岛屿火箭队仓库输入密码后，需击败内部成员夺回蓝宝石。完成该任务可解锁关都地区与七岛的通讯功能。随后前往第七岛屿最北端的阿斯卡纳遗迹，此处需使用怪力技能推动七个石室内的石块填平坑洞，每完成一个石室会释放对应形态的未知图腾。注意石块推动顺序需遵循从左至右、自上而下的规律，错误操作可能导致机关重置。
最终阶段需返回水蓝市，华蓝洞窟看守消失后使用冲浪进入深处捕捉超梦。遗迹山谷整体探索涉及密码获取、多重迷宫解谜和连续战斗，建议队伍中配置水系、格斗系宝可梦应对不同地形需求。关键道具如探宝器和穿洞绳可提升探索效率，但非必须条件。
