蜂蜜是一种多功能资源，既可用于食物恢复生命值，也能用于制作药膏或装饰性方块。获取蜂蜜的核心方法是利用蜂巢或蜂箱，通过合理操作避免蜜蜂攻击。自然生成的蜂巢通常出现在平原、繁花森林等生物群系的橡树或白桦树上。使用玻璃瓶右键点击装满蜂蜜的蜂巢可直接获取蜂蜜瓶，但需注意蜜蜂的敌对状态。为避免被攻击，可在蜂巢下方放置营火，烟雾会安抚蜜蜂使其不主动攻击。若蜂巢未满，需等待蜜蜂完成采蜜，其飞行轨迹会携带花粉颗粒，最终将蜂蜜存入蜂巢。
使用精准采集附魔工具破坏蜂巢可获得带蜜蜂的蜂巢方块，或通过捕虫网捕捉野生蜜蜂。将蜂巢或合成蜂箱（由蜜脾与木板制作）放置在花朵附近，蜜蜂会主动入住并采蜜。蜂箱需周围种植至少一朵花以维持蜜蜂工作，花朵种类不影响效率但需保证数量。蜜蜂采蜜后返回蜂箱会逐渐增加蜂蜜储量，蜂箱状态可通过外观变化判断。
设计蜜脾收集器需在蜂箱下方放置发射器与漏斗系统，发射器内装入玻璃瓶，通过红石信号触发自动收集蜂蜜瓶。另一种方法是在蜂箱下方直接放置漏斗连接箱子，但需手动操作玻璃瓶。自动化系统需注意蜜蜂路径不被阻挡，否则影响采蜜效率。营火或火把需持续提供烟雾以保持蜜蜂中立状态。
蜂蜜的合成应用包括食物与建筑装饰。蜂蜜瓶可直接饮用恢复饥饿值，或用于酿造隐身药水。四个蜂蜜瓶可合成蜂蜜块，具有减速与缓冲跌落伤害的特性，适合搭建陷阱或安全通道。蜜脾块则纯粹用于装饰，需通过剪刀右键采集蜂巢获得蜜脾后合成。蜂蜜块与粘液块组合可实现弹跳装置，但需注意其粘性差异。
